一、办公室（党委办公室）主要职能：承担机关日常综合性事务，负责文秘、信息、政务公开、会务、信访、机要保密、档案、税收宣传、值班值守、督查督办等工作。
二、政策法规处主要职能：承担依法行政工作；起草相关税种、社会保险费和非税收入综合性政策文件；承担规范性文件合法性审查工作；承担重大执法决定法制审核工作；组织协调重大税务案件审理；组织办理税务行政复议、行政应讼工作。
三、货物和劳务税处（进出口税收管理处）主要职能：组织实施增值税、消费税、车辆购置税和进出口税收等征收管理工作；组织落实相关税种的税收优惠政策；承担相关税种和进出口税收具体业务问题的解释和处理；参与相关税种和进出口税收的风险管理和纳税辅导、咨询服务、法律救济等工作；承担增值税发票管理工作。
四、企业所得税处主要职能：组织实施企业所得税征收管理工作；组织落实企业所得税税收优惠政策；承担企业所得税具体业务问题的解释和处理；参与企业所得税风险管理和纳税辅导、咨询服务、法律救济等工作。
五、个人所得税处主要职能：组织实施个人所得税征收管理工作；组织落实个人所得税税收优惠政策；承担个人所得税具体业务问题的解释和处理；参与个人所得税风险管理和纳税辅导、咨询服务、法律救济等工作。
六、财产和行为税处主要职能：组织实施房产税、城镇土地使用税、土地增值税、契税、城市维护建设税、印花税等征收管理工作；组织落实相关税种税收优惠政策；承担相关税种具体业务问题的解释和处理；参与相关税种的风险管理和纳税辅导、咨询服务、法律救济等工作。
七、资源和环境税处主要职能：组织实施资源税、环境保护税、车船税、耕地占用税和烟叶税等征收管理工作；组织落实相关税种税收优惠政策；承担相关税种具体业务问题的解释和处理；参与相关税种的风险管理和纳税辅导、咨询服务、法律救济等工作。
八、社会保险费处主要职能：组织实施基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费等社会保险费征收管理工作；参与有关社会保险费征收的政策辅导、咨询服务、法律救济等工作。
九、非税收入处主要职能：组织实施文化事业建设费、教育费附加和地方教育附加等有关非税收入的征收管理工作；参与有关非税收入征收的政策辅导、咨询服务、法律救济等工作。
十、收入规划核算处主要职能：组织实施税收、社会保险费和有关非税收入的中长期规划；拟订出口退（免）税年度安排，组织实施免抵调库年度安排；统筹协调组织收入工作，组织实施税收收入的预测、预警分析和重点税源监控管理工作。
十一、纳税服务处主要职能：组织开展纳税服务工作；承担税法宣传、纳税辅导、咨询服务、办税服务、税收信用体系建设和权益保护等工作；落实涉税专业服务监管政策及制度。
十二、征管和科技发展处主要职能：组织实施税收征管法律法规、规章及规范性文件；承担税务登记、纳税申报、普通发票管理等征管工作；组织实施信息化建设工作。
十三、国际税收管理处主要职能：组织实施国家（地区）间税收条约（安排）；承担跨境税收管理工作；承担非居民所得、居民境外所得税收管理等跨境税收管理工作；组织实施反避税工作；负责外事管理。
十四、税收经济分析处主要职能：组织实施税收经济分析工作；运用税收数据对本地区经济运行情况开展动态监控分析；承担税收政策效应分析工作。
十五、财务管理处（装备和采购处）主要职能：组织实施预决算、基建、会计核算、财务内控和政府采购、固定资产等工作；组织实施国库集中收付工作。
十六、督察内审处主要职能：组织实施税收、社会保险费和有关非税收入的执法督察；组织实施预算执行、基本建设、政府采购等内部财务审计和领导干部经济责任审计；参与实施“一案双查”工作。
十七、人事处（党委组织部）主要职能：组织实施干部人事制度及人才队伍建设；承担人事、机构编制、干部考核、劳动工资等工作。指导系统党的组织建设、党员队伍建设等工作。
十八、考核考评处主要职能：组织实施绩效管理和数字人事管理工作；承担年度绩效考评工作。
十九、教育处主要职能：组织实施教育培训工作；承担教育培训机构业务管理等工作。
二十、党建工作处（党委宣传部、巡察工作办公室）主要职能：统筹和指导系统党群工作，宣传和执行党的路线方针政策；组织和指导系统巡察工作。
二十一、机关党委主要职能：承担机关和派出机构党群工作。
二十二、老干部处主要职能：承担机关和派出机构老干部工作；指导系统老干部工作。
根据有关规定，设置党委纪检组，负责机关和派出机构党的纪律检查工作；指导系统党的纪律检查工作。
