国家卫生计生委与中国疾病预防控制中心是上下级关系。疾控中心是国家卫计委的直属下级机构。国家卫生计生委的全称是中华人民共和国国家卫生健康委员会。

包含有以下机构：

1、办公厅

负责机关日常运转，承担安全、保密、政务公开等工作。

2、人事司

拟订卫生健康人才发展政策，承担机关和直属单位的人事管理、机构编制和队伍建设等工作，负责卫生健康专业技术人员资格管理。

3、规划发展与信息化司

承担健康中国战略协调推进工作，组织拟订卫生健康事业发展中长期规划，指导卫生健康服务体系及信息化建设，组织开展爱国卫生运动和卫生健康统计工作。

承担《烟草控制框架公约》牵头履约工作。

4、财务司

承担机关和预算管理单位预决算、财务、资产管理和内部审计工作。